生物安全实验室一级可自然通风，二级可采用带循环风的空调系统，涉及有毒、有害等操作，采用全排风。三、四级实验室防护区应采用全新风。?净化空调系统应在新风口、风机正压段和送风末端设三级空气过滤。其中新风过滤视当地大气尘污染情况可用粗效十中效过滤器或粗效十中效十高中效或亚高教过滤器。

三、四级实验室必须设室内排风口，并在近风口处安装国标B类（含）以上过滤器，同时应具备现场原位扫描检漏和消毒的条件。四级实验室应有两道排风高效过滤器。?宜采用上送下排气流组织，但饲养大动物的生物安全实验室宜采用上进上排方式。?在排风过滤器与排风机之间应安装气密阀。

排风应先于送风开启，后于送风关闭，送排风联锁。排风机应有备用。?保持生物安全实验室的逐级的负压差，是空气净化的最主要的任务，保证气流由辅助区流向防护区。对动物生物安全实验宣负压的要求又高于普通生物安全实验室，因为动物源性的污染源是最危险的污染源。一般来说，危险度最大的车间。